-  Todos los puntos señalados por el equipo auditor fueron debidamente respondidos y justificados en tiempo y conforme a las disposiciones legales que respaldan las actuaciones de la SET. Varios de los  cuestionamientos realizados por la CGR, se refieren a sentencias de la Corte Suprema de Justicia relacionados a procesos anteriores a esta Administración.

 
-  En relación al acceso a la información contenida en el Sistema Marangatú, la posición institucional del Ministerio de Hacienda es la de mantener en resguardo el secreto tributario por constituir Patrimonio Documental inviolable, fundamentado en la Constitución Nacional y conforme al dictamen de la Abogacía del Tesoro. No obstante, toda la documentación relacionada a la gestión institucional de la SET ha sido puesta a disposición del equipo auditor;

-  En el caso señalado de que la SET dio curso al pedido de prescripción de una obligación tributaria, la misma corresponde a supuestas obligaciones que datan de los años 1992 a 1995. En tal sentido la Administración Tributaria ha realizado una reingeniería en sus sistemas tributarios a partir del año 2007, siendo el caso señalado un resabio de los defectos del anterior sistema tributario;

-  Con  respecto a la gestión de la SET sobre intereses pagados por mora en la devolución de los créditos tributarios, se aclaró en su momento que los casos señalados corresponden a sentencias de la Corte Suprema de Justicia que obligó a la SET a devolver créditos tributarios más intereses sobre procesos de devolución en donde la SET interpretó correctamente la Ley 125/91 no teniendo la Subsecretaría otra alternativa sino cumplir con los mandatos de la máxima instancia judicial;

-  En  su lucha contra la corrupción, la SET implementó un sistema de control interno que permitió detectar irregularidades en el otorgamiento de créditos tributarios; estos casos fueron denunciados a principios del año 2009 al Ministerio Público, arrimándose toda la documentación probatoria de los hechos punibles, la sanción a los responsables depende de los resultados del trabajo de investigación que realiza la Fiscalía de Delitos Económicos;

-  Con referencia a las fiscalizaciones, la SET cuenta con varios mecanismos o procedimientos de control previstos en las normativas legales vigentes como ser: controles internos a contribuyentes (cruce de informaciones), programas persuasivos, disuasivos y ejecutivos. La aplicación de cualquiera de los procedimientos de control es realizado a un grupo de contribuyentes que reúne ciertas condiciones de incumplimiento o inconsistencia abarcando a todas las categorías y segmentos de contribuyentes, conforme a un plan de trabajo elaborado previamente y a la infraestructura disponible; los resultados se ven reflejados en el aumento de las recaudaciones principalmente y en la percepción del riesgo subjetivo.

-  La SET ha tenido que afrontar innumerables obstáculos como consecuencia de la Reingeniería de los Sistemas Tributarios, principalmente en el cambio de la mentalidad en el pago de impuestos, tanto en la sociedad como en los mismos funcionarios; sin embargo, la actual Administración Tributaria no ha escatimado esfuerzos para trabajar en forma sistemática y frontal para erradicar la corrupción y transparentar su gestión, velando por el patrimonio documental de los contribuyentes, de los cuales es depositario, y cumpliendo a cabalidad su función recaudadora para que el Gobierno Nacional pueda sostener el Presupuesto General de la Nación.